Applied Biosystems Axiom Porcine Breeders Array inclui marcadores focados na seleção genômica de raças suínas comerciais, incluindo Large White, Landrace, Duroc e Pietrain. Os marcadores centrais para a matriz foram selecionados a partir de marcadores na matriz de alta densidade suína Axiom que foram avaliados utilizando amostras de múltiplas raças comerciais e domésticas, incluindo os javalis europeus. A inclusão dos marcadores mais informativos e de melhor desempenho das matrizes suínas existentes garante que esta matriz possa ser utilizada para comparar com os dados gerados por estudos anteriores. Com a disponibilidade da ferramenta de exportação de formato longo Axiom, que converte os dados da matriz Axiom em formato longo, a matriz também oferece a capacidade de continuar com os projetos existentes sem mudanças na infraestrutura e na carteira de bioinformática atual.

As características incluem:
• 55.150 marcadores para a seleção genômica e de características
• 42 marcadores específicos de características selecionados pelo Departamento de Agricultura dos Estados Unidos
• 64 marcadores de parentesco, incluindo os marcadores centrais do ISAG
• SNPs distribuídos uniformemente em todo o genoma suíno
• Anotações de marcadores alinhadas com o genoma Sscrofa10.2 / susScr3 e dbSNP 148
• Direcionado para raças comerciais incluindo Large White, Landrace, Duroc e Pietrain

Aplicações

• Análise de parentesco
• Identificação de características de importância econômica
• Melhoria genética de linhas puras